Еще лет пять назад проблем у него была куча. В их числе хроническая бессонница, боязнь толпы, сигареты одна за другой, и неизбывная враждебность по отношению ко всем представителям власти, стоившая ему трех, хотя и небольших, тюремных сроков: крупная ссора с полицейским в Лос-Анджелесе, крупная драка с гостиничным в Ванкувере и превышение скорости в Аризоне. В 1994 году арест за разгром гостиничного номера в Нью-Йорке, в январе 1999 года арест за драку с журналистами перед рестораном в Лондоне. Хотя тогда он защищал от посягательств папарацци свою гражданскую жену Ванессу Паради.
К тому же частые смены даже не настроения, чуть ли не личности: «Бывает, просыпаюсь я совсем не тем человеком, которым лег спать. Неудивительно, что со мной трудно ужиться».
О личной жизни Депп предпочитает не распространятся. Это и понятно, принимая во внимание его неуживчивость, а также громкие романы с Шерилин Фенн, Дженнифер Грей, Самантой Янус, Вайноной Райдер, Кейт Мосс. С Вайноной они то съезжались, то разъезжались в течении четырех лет, теперь она ушла из его жизни, а татуировка на плече "Вайнона навсегда" превратилась в какую-то непонятную вязь "Вино навсегда". Ему всегда хотелось свободы.
Расставшись в 1998 году с моделью Кейт Мосс, роман с которой длился около 4 лет, Джонни вскоре познакомился на одной из светских вечеринок с молодой французской певицей и актрисой Ванессой Паради и был покорен ею раз и навсегда. Влюбленные переехали во Францию для того, чтобы начать там новую жизнь. В местечке Сан Тропе Джонни купил для семьи огромное ранчо. «Мне всегда хотелось, чтобы вокруг было пространство, чтобы можно было скакать на лошади или гонять на мотоцикле и не думать о превышении скорости или о том, что каждую секунду перед тобой может кто-то возникнуть и что-то сказать», - как-то сказал Джонни. Также в Париже недалеко от Монмарта у Джонни имеется квартира.
Ванесса пристрастила Джонни к гамбургерам, к тому, что раньше он терпеть не мог. Любовь – великая сила!
В мае 1999 года у Джонни и Ванессы родилась дочь Лилли Роуз Мэлоди Депп. А 9 апреля 2002 года Ванесса родила Джонни сына Джека. Похоже Джонни очень счастлив. Он обожает своих детей. Все свободное время от съемок время он проводит с детьми, водит в Диснейленд, играет в компьютерные игры, гуляет. Когда Лили и Джек были маленькие, даже менял им памперсы. О детях Джонни может говорить бесконечно, рассказывать об их достижениях в познании мира, хотя в молодости он боялся и даже ненавидел детей. Он, как коршун, заклюет любого папарацци, если тот только приблизиться к его малюткам. Джонни охраняет свой мир, в котором живут его самые дорогие люди: Ванесса, Лили, Джек - и никого не желает туда пускать. Неугомонный Джонни наконец-то остепенился, у него есть настоящая семья. Мир дому твоему Джонни!